Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

(Back to Minerals by class)

19 Adenosine-3'-phosphate dihydrate

(Previous)     (Back)     (Next)
                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     6.34  11.90   9.94  87.78  90.00  90.00    749.4   1.698
                                       PM6:     5.91  11.62  10.55  88.60  89.95  90.16    724.9   1.756
                 X-Ray                               PM6
 
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(2,1,1)
 Adenosine-3'-phosphate dihydrate
 h=  hr=NIST
  O        -0.11856019 +1   -0.1848266 +1    0.2668399 +1                      0.0000
  C        -5.00836928 +1   -0.0356483 +1    3.2238955 +1                      0.0000
  C        -4.43842777 +1    1.3850543 +1    3.4525924 +1                      0.0000
  C        -4.51697481 +1    1.8468801 +1    4.9088390 +1                      0.0000
  C        -0.16254969 +1   -3.4748582 +1    1.8516044 +1                      0.0000
  C        -0.95240792 +1   -1.6826042 +1    3.0343076 +1                      0.0000
  C        -0.21740021 +1   -2.0469537 +1    4.2073162 +1                      0.0000
  C         0.60191972 +1   -3.2260789 +1    4.1790301 +1                      0.0000
  C        -1.33428410 +1   -0.2253182 +1    4.7077685 +1                      0.0000
  C        -2.67971778 +1    0.1043948 +1    2.4605632 +1                      0.0000
  H         1.14533010 +1   -4.8693444 +1    2.8063223 +1                      0.0000
  H        -3.78192449 +1    1.3132695 +1    5.5537731 +1                      0.0000
  H        -5.54205060 +1    1.7054913 +1    5.3057591 +1                      0.0000
  H        -4.95404934 +1    3.8116582 +1    5.0753325 +1                      0.0000
  H        -7.29868624 +1   -2.6201988 +1    2.0870335 +1                      0.0000
  H        -4.70922482 +1   -0.1270259 +1    0.6569256 +1                      0.0000
  H        -0.10698802 +1   -4.1133552 +1    0.9373161 +1                      0.0000
  H         1.30205101 +1   -3.2060358 +1    6.1273207 +1                      0.0000
  H         1.96478231 +1   -4.5026843 +1    5.1505879 +1                      0.0000
  H        -1.75187608 +1    0.6577455 +1    5.2176783 +1                      0.0000
  H        -2.21762201 +1    0.3423567 +1    1.4617136 +1                      0.0000
  H        -3.77976971 +1   -1.8429957 +1    2.7441528 +1                      0.0000
  H        -5.18921315 +1   -0.5833948 +1    4.1905993 +1                      0.0000
  H        -4.89166058 +1    2.1319472 +1    2.7587925 +1                      0.0000
  N         0.58783959 +1   -3.9209056 +1    2.9491544 +1                      0.0000
  N        -0.92071970 +1   -2.3848853 +1    1.8363657 +1                      0.0000
  N         1.29604105 +1   -3.7002395 +1    5.2245349 +1                      0.0000
  N        -0.47062425 +1   -1.1123797 +1    5.2259524 +1                      0.0000
  N        -1.66131113 +1   -0.5278735 +1    3.3503143 +1                      0.0000
  O        -3.02501717 +1    1.3440447 +1    3.0670887 +1                      0.0000
  O        -4.32812735 +1   -0.9731363 +1    1.0336488 +1                      0.0000
  O        -6.18183188 +1    0.1090457 +1    2.4280715 +1                      0.0000
  O        -4.13771439 +1    3.2277237 +1    4.9963363 +1                      0.0000
  O        -8.62098140 +1   -0.1288746 +1    2.0264774 +1                      0.0000
  O        -7.32615525 +1   -2.1561204 +1    3.0538618 +1                      0.0000
  O        -7.77507318 +1   -0.0912534 +1    4.5004997 +1                      0.0000
  P        -7.58718886 +1   -0.5556049 +1    3.0698602 +1                      0.0000
  C        -3.95076276 +1   -0.7973492 +1    2.3762233 +1                      0.0000
  C        -3.14611365 +1    2.2404004 +1   -1.4430949 +1                      0.0000
  C        -2.07631606 +1    3.0139202 +1   -2.2643045 +1                      0.0000
  C        -2.63132893 +1    4.4440879 +1   -2.4653171 +1                      0.0000
  C        -2.54516460 +1    4.9352177 +1   -3.9117706 +1                      0.0000
  C        -6.97353764 +1   -0.3841292 +1   -0.9307444 +1                      0.0000
  C        -6.15572189 +1    1.4086760 +1   -2.0953376 +1                      0.0000
  C        -6.88638333 +1    1.0615649 +1   -3.2757329 +1                      0.0000
  C        -7.71614532 +1   -0.1101974 +1   -3.2629578 +1                      0.0000
  C        -5.74935029 +1    2.8769138 +1   -3.7535349 +1                      0.0000
  C        -4.40400888 +1    3.1628676 +1   -1.5003177 +1                      0.0000
  H        -8.27951519 +1   -1.7606324 +1   -1.9101873 +1                      0.0000
  H        -3.27423342 +1    4.4132796 +1   -4.5729059 +1                      0.0000
  H        -1.51716012 +1    4.8067867 +1   -4.3050072 +1                      0.0000
  H        -2.11577489 +1    6.9045929 +1   -4.0489687 +1                      0.0000
  H         0.13997613 +1    0.3769198 +1   -1.1452238 +1                      0.0000
  H        -2.38516457 +1    2.8318066 +1    0.3042334 +1                      0.0000
  H        -7.04643622 +1   -1.0266934 +1   -0.0190089 +1                      0.0000
  H        -8.40173781 +1   -0.0656265 +1   -5.2166209 +1                      0.0000
  H        -9.08206925 +1   -1.3658118 +1   -4.2551249 +1                      0.0000
  H        -5.32205786 +1    3.7615842 +1   -4.2540762 +1                      0.0000
  H        -4.85777938 +1    3.3881711 +1   -0.4949424 +1                      0.0000
  H        -3.33278093 +1    1.2110310 +1   -1.8496042 +1                      0.0000
  H        -1.89378664 +1    2.4868632 +1   -3.2423646 +1                      0.0000
  H        -2.17244117 +1    5.1729569 +1   -1.7557756 +1                      0.0000
  N        -7.71756448 +1   -0.8153268 +1   -2.0387214 +1                      0.0000
  N        -6.20331587 +1    0.6973658 +1   -0.9029252 +1                      0.0000
  N        -8.40787389 +1   -0.5679265 +1   -4.3172219 +1                      0.0000
  N        -6.61769215 +1    2.0022492 +1   -4.2846781 +1                      0.0000
  N        -5.43479232 +1    2.5601673 +1   -2.3963126 +1                      0.0000
  O        -4.04611110 +1    4.4095429 +1   -2.0849379 +1                      0.0000
  O        -2.77377382 +1    2.0063771 +1   -0.1088096 +1                      0.0000
  O        -0.90560526 +1    3.1300323 +1   -1.4587324 +1                      0.0000
  O        -2.92955268 +1    6.3165127 +1   -3.9691656 +1                      0.0000
  O         1.52653605 +1    2.8433139 +1   -1.0510413 +1                      0.0000
  O         0.19702618 +1    0.8520550 +1   -2.1049277 +1                      0.0000
  O         0.69183941 +1    2.9261609 +1   -3.5266486 +1                      0.0000
  P         0.49042756 +1    2.4467371 +1   -2.1032487 +1                      0.0000
  H         4.43418410 +1   -0.3930672 +1   -5.5491526 +1                      0.0000
  H         5.70672783 +1   -0.0377691 +1   -4.6744038 +1                      0.0000
  O         5.31010259 +1   -0.7387586 +1   -5.2119851 +1                      0.0000
  H        -0.38525106 +1    2.5742370 +1   -4.8279337 +1                      0.0000
  H        -1.65413003 +1    2.9743386 +1   -5.6881203 +1                      0.0000
  O        -1.26767943 +1    2.2535143 +1   -5.1708843 +1                      0.0000
  H        -7.85235746 +1   -3.3120341 +1    0.1351804 +1                      0.0000
  H        -6.53663352 +1   -3.8813539 +1    0.7705750 +1                      0.0000
  O        -7.04063158 +1   -3.0478558 +1    0.6334986 +1                      0.0000
  H         0.69341598 +1   -0.4595861 +1    0.7577575 +1                      0.0000
  H        -0.59104319 +1   -1.0246170 +1    0.0613343 +1                      0.0000
  O        -0.12958619 +1   -6.0926692 +1    0.2195465 +1                      0.0000
  C        -5.02776682 +1   -5.9288359 +1    3.1866208 +1                      0.0000
  C        -4.45637764 +1   -4.5086679 +1    3.4120216 +1                      0.0000
  C        -4.53402727 +1   -4.0425070 +1    4.8666940 +1                      0.0000
  C        -0.18672121 +1   -9.3745751 +1    1.8043123 +1                      0.0000
  C        -0.97430331 +1   -7.5827898 +1    2.9897826 +1                      0.0000
  C        -0.23576070 +1   -7.9473358 +1    4.1605120 +1                      0.0000
  C         0.58547773 +1   -9.1255357 +1    4.1287144 +1                      0.0000
  C        -1.34909578 +1   -6.1242780 +1    4.6639298 +1                      0.0000
  C        -2.70031218 +1   -5.7929186 +1    2.4204035 +1                      0.0000
  H         1.12482195 +1  -10.7694145 +1    2.7545817 +1                      0.0000
  H        -3.80730337 +1   -4.5824210 +1    5.5156592 +1                      0.0000
  H        -5.56185499 +1   -4.1705104 +1    5.2607680 +1                      0.0000
  H        -4.94951630 +1   -2.0725579 +1    5.0370275 +1                      0.0000
  H        -7.29458443 +1   -8.5236140 +1    2.0419651 +1                      0.0000
  H        -4.73418134 +1   -6.0280099 +1    0.6200986 +1                      0.0000
  H        -0.13331571 +1  -10.0127692 +1    0.8898415 +1                      0.0000
  H         1.28910023 +1   -9.1054382 +1    6.0755858 +1                      0.0000
  H         1.95691112 +1  -10.3964521 +1    5.0958400 +1                      0.0000
  H        -1.76304654 +1   -5.2399815 +1    5.1756166 +1                      0.0000
  H        -2.24016532 +1   -5.5556051 +1    1.4203981 +1                      0.0000
  H        -3.80155802 +1   -7.7384579 +1    2.7101726 +1                      0.0000
  H        -5.20981638 +1   -6.4737626 +1    4.1547823 +1                      0.0000
  H        -4.90962735 +1   -3.7630812 +1    2.7163429 +1                      0.0000
  N         0.56914145 +1   -9.8197142 +1    2.8990798 +1                      0.0000
  N        -0.94685044 +1   -8.2859708 +1    1.7919666 +1                      0.0000
  N         1.28563589 +1   -9.5972699 +1    5.1712350 +1                      0.0000
  N        -0.48559906 +1   -7.0129862 +1    5.1798811 +1                      0.0000
  N        -1.68073618 +1   -6.4270297 +1    3.3075804 +1                      0.0000
  O        -3.04297241 +1   -4.5522139 +1    3.0262043 +1                      0.0000
  O        -4.35165521 +1   -6.8730924 +1    0.9980371 +1                      0.0000
  O        -6.20102192 +1   -5.7828533 +1    2.3900758 +1                      0.0000
  O        -4.13914221 +1   -2.6656578 +1    4.9482023 +1                      0.0000
  O        -8.63519999 +1   -6.0466144 +1    1.9756091 +1                      0.0000
  O        -7.32496496 +1   -8.0608471 +1    3.0083508 +1                      0.0000
  O        -7.80186002 +1   -6.0042230 +1    4.4548329 +1                      0.0000
  P        -7.60183170 +1   -6.4624470 +1    3.0240641 +1                      0.0000
  C        -3.97215168 +1   -6.6939348 +1    2.3398631 +1                      0.0000
  C        -3.16614167 +1   -3.6625277 +1   -1.4943487 +1                      0.0000
  C        -2.09929143 +1   -2.8866382 +1   -2.3168407 +1                      0.0000
  C        -2.65775659 +1   -1.4578261 +1   -2.5169575 +1                      0.0000
  C        -2.57136189 +1   -0.9669218 +1   -3.9633202 +1                      0.0000
  C        -6.98906259 +1   -6.3035964 +1   -0.9794465 +1                      0.0000
  C        -6.17579281 +1   -4.5059120 +1   -2.1411966 +1                      0.0000
  C        -6.91159358 +1   -4.8507193 +1   -3.3194978 +1                      0.0000
  C        -7.74123060 +1   -6.0225321 +1   -3.3069888 +1                      0.0000
  C        -5.78167181 +1   -3.0312023 +1   -3.7963004 +1                      0.0000
  C        -4.42699870 +1   -2.7442675 +1   -1.5504243 +1                      0.0000
  H        -8.30482215 +1   -7.6751154 +1   -1.9565908 +1                      0.0000
  H        -3.29503734 +1   -1.4948181 +1   -4.6255593 +1                      0.0000
  H        -1.54158017 +1   -1.0891119 +1   -4.3539813 +1                      0.0000
  H        -2.15358625 +1    1.0045919 +1   -4.1090578 +1                      0.0000
  H         0.11955148 +1   -5.5322659 +1   -1.1962874 +1                      0.0000
  H        -2.41080105 +1   -3.0613436 +1    0.2523707 +1                      0.0000
  H        -7.05745146 +1   -6.9492128 +1   -0.0695694 +1                      0.0000
  H        -8.43218506 +1   -5.9733941 +1   -5.2581888 +1                      0.0000
  H        -9.11019163 +1   -7.2756133 +1   -4.2988344 +1                      0.0000
  H        -5.35852167 +1   -2.1438076 +1   -4.2955738 +1                      0.0000
  H        -4.87862216 +1   -2.5172940 +1   -0.5441774 +1                      0.0000
  H        -3.34963626 +1   -4.6928649 +1   -1.8983256 +1                      0.0000
  H        -1.91612834 +1   -3.4116468 +1   -3.2958904 +1                      0.0000
  H        -2.20120252 +1   -0.7277329 +1   -1.8070274 +1                      0.0000
  N        -7.73997462 +1   -6.7303028 +1   -2.0843813 +1                      0.0000
  N        -6.21823036 +1   -5.2223501 +1   -0.9514301 +1                      0.0000
  N        -8.43612332 +1   -6.4777922 +1   -4.3602407 +1                      0.0000
  N        -6.64988486 +1   -3.9060296 +1   -4.3268713 +1                      0.0000
  N        -5.45869328 +1   -3.3516702 +1   -2.4424753 +1                      0.0000
  O        -4.07323935 +1   -1.4974139 +1   -2.1385961 +1                      0.0000
  O        -2.79008445 +1   -3.8920801 +1   -0.1598902 +1                      0.0000
  O        -0.92802226 +1   -2.7698216 +1   -1.5119693 +1                      0.0000
  O        -2.96448824 +1    0.4117388 +1   -4.0233342 +1                      0.0000
  O         1.50152609 +1   -3.0668838 +1   -1.1001222 +1                      0.0000
  O         0.17006982 +1   -5.0557716 +1   -2.1542076 +1                      0.0000
  O         0.67026483 +1   -2.9846473 +1   -3.5765526 +1                      0.0000
  P         0.46514053 +1   -3.4611224 +1   -2.1528620 +1                      0.0000
  H         4.40871486 +1   -6.2893752 +1   -5.5853973 +1                      0.0000
  H         5.68915950 +1   -5.9446346 +1   -4.7207036 +1                      0.0000
  O         5.28615951 +1   -6.6403260 +1   -5.2601506 +1                      0.0000
  H        -0.40738967 +1   -3.3286909 +1   -4.8743989 +1                      0.0000
  H        -1.67301742 +1   -2.9296628 +1   -5.7387170 +1                      0.0000
  O        -1.29113292 +1   -3.6488705 +1   -5.2148294 +1                      0.0000
  H        -7.86965316 +1   -9.2190732 +1    0.0928699 +1                      0.0000
  H        -6.54865038 +1   -9.7894079 +1    0.7146839 +1                      0.0000
  O        -7.05380230 +1   -8.9555621 +1    0.5837525 +1                      0.0000
  H         0.68393325 +1   -6.3706461 +1    0.7054794 +1                      0.0000
  H        -0.61040135 +1   -6.9289361 +1    0.0214751 +1                      0.0000
 Tv        -0.05030202 +1  -11.8274483 +1   -0.1047779 +1 
 Tv         0.58348919 +1    0.1332516 +1  -11.6048840 +1 
 Tv        10.54849380 +1   -0.0568733 +1    0.2710071 +1